Dudas laborales

Tengo dudas laborales, quisiera de todas sus ayudas.

Tengo un trabajo (primer trabajo) llevo aprox. 6 meses y es a honorarios. El sueldo es alto (a mi parecer, hablo de aprox. 1M) mi consulta es con respecto a las cotizaciones y el sii.
Estoy actualmente cotizando por el mínimo (no me juzgen, en realidad no sé si esto afecta o no en algo) como trabajadr independiente, cumplo con pagar afp y Fonasa cada mes. Las consultas son las siguientes, y he revisado el sii, pero realmente no logro entender algunos terminos y me gustaría si alguno pudiera explicarme en un lenguaje más sencillo.

1. ¿Es posible pedir licencia y que me paguen? Consulto porque el trabajo requiere mucho movimiento robótico y estamos todos los colegas con tendinitis, y la gran mayoría desconoce el tema más administrativo. Algunos no cotizan, otros cotizan por el mínimo. Al ser honorarios nos habían dicho que no se puede llamar una persona de reemplazo, por lo tanto, entre colegas debíamos cubrir la falta de personal y nadie ha solicitado licencia para no sobrecargar al otro.

2. ¿Que ocurre con la devolución de renta? El año pasado se hicieron descuentos que honestamente no entendí bien, a mi parecer era para cubrir afp y salud a quienes no habían cotizado. ¿Este año será igual? Estuve leyendo y dice que ahora será el 27% de la renta bruta, pero si cotizo por el mínimo ¿Se me descontará algo de la devolución de renta?
A los colegas que no cotizan, ¿Les retendrán el dinero, o el 27% de la devolución?

Quedo atent@ a sus comentarios, y agradezco enormemente su ayuda.